Основу принципа анаэробной очистки составляет разложение биоматериала небольшой группой микроорганизмов, которые размножаются в бескислой среде. Этот способ применяют в промышленности, в современных комплексах глубокой очистки при многоуровневой фильтрации воды.
Анаэробные биологические методы очистки сточных вод используются в самых разных отраслях промышленности для избавления стоков от загрязнений органического характера. Такие методы привлекают потребителей тем, что при очищении сточных вод и уменьшении в них концентрации ХПК (химическое потребление кислорода) образуется в результате биогаз, который может стать источником тепла или электричества при сжигании. Вдобавок к этому при применении анаэробных методов очистки не происходит образования большого количества избыточного активного ила.
Особую трудность инженерам и технологам доставляет очищение прежде всего сточных вод, имеющих однородный состав, например, загрязненных, в основном, жирами, - так называемых моносточных вод. В таких ситуациях при проектировании очистных станций обязательно учитывают условия, необходимые для разложения микроорганизмами основных органических компонентов, что и должно являться основой технологического процесса, имеющего целью достижение максимальной эффективности очистки при минимизации при этом инвестиционных затрат.
На сегодняшний день созданы биоочистные малогабаритные станции, которые можно применять в условиях ограниченной площади частного дома.